de.wedoany.com-Bericht: In der zweiten Keynote-Session der Bio-IT World Conference 2026 diskutierten mehrere Experten über den Einsatz von Foundation-Modellen und föderiertem Lernen in der Wirkstoffentwicklung. Zu den Panelteilnehmern gehörten Dr. Woody Sherman, Gründer und Chief Innovation Officer von PsiThera, Dr. Mohammed AlQuraishi, Assistenzprofessor für Systembiologie an der Columbia University, Dr. Jonathan Gilbert, Senior Director für Ecosystem Growth & Contributor Collaboration bei Eli Lilly, Dr. José-Tomás Prieto, AI Program Director bei Apheris, Dr. Arman Zaribafiyan, Leiter der strategischen Allianzen für KI-Simulation bei SandboxAQ, sowie Dr. Christina Taylor, Senior Research Scientist und Leiterin des Bereichs Computational Molecular Design bei Bayer.

Sherman betonte, dass offene Plattformen dazu beitragen, den Fortschritt in der Wirkstoffentwicklung voranzutreiben, und dass die Branche gemeinsam Foundation-Modelle entwickeln sollte, die anschließend durch föderiertes Lernen weiter optimiert werden können.

AlQuraishi wies darauf hin, dass AlphaFold kurzfristig große Fortschritte bei der Vorhersage von Proteinstrukturen ermöglicht habe, jedoch bei der Modellierung seiner Nicht-Protein-Komponenten weiterhin Einschränkungen bestehen. Er stellte OpenFold als Open-Source-Alternative zu AlphaFold vor, die von über 40 Institutionen getragen wird und ein reproduzierbares öffentliches Plattformangebot bereitstellen soll. OpenFold sei sowohl ein Toolkit als auch eine akademisch-industrielle Allianz, die der Branche steuerbare Mechanismen bieten könne.

Gilbert erläuterte, dass Eli Lilly im Jahr 2025 die Plattform TuneLab eingeführt habe, die Biotechnologieunternehmen KI-Modelle kostenlos zur Verfügung stellt, jedoch die Bereitstellung von Trainingsdaten voraussetzt. Der Wert der von Lilly in das Modelltraining investierten Daten übersteige eine Milliarde US-Dollar. Die Plattform habe derzeit über 75 Partner und werde in Dutzenden von Ländern auf drei Kontinenten genutzt. Lilly habe zudem eine Vereinbarung mit der Collaborative Drug Discovery (CDD) getroffen, um TuneLab in die CDD-Vault-Plattform zu integrieren.

Prieto diskutierte die Komplexität bei der Implementierung von föderiertem Lernen und wies darauf hin, dass das neue Paradigma darin bestehe, dass die Datenvorbereitung nicht zentralisiert werden müsse, jedes Unternehmen jedoch Standards und Rechenumgebungen koordinieren müsse. Das von Apheris unterstützte KI-Strukturbiologie-Netzwerk vereine mehrere der 20 größten Biopharmaunternehmen und ermögliche es KI-Modellen, auf proprietären Proteindaten zu trainieren, während die Datensicherheit gewährleistet bleibe.

Zaribafiyan betonte, dass Feintuning die Lücke zwischen allgemeinen Modellen und realen Anwendungsfällen in der Wirkstoffentwicklung erheblich verkleinern könne. SandboxAQ arbeite mit OpenFold zusammen und habe die Einführung einer neuen Plattform angekündigt, die quantitative Modelle mit großen Sprachmodellen verbindet, sodass Wissenschaftler Simulationen und Workflows über natürliche Sprache starten können.

Taylor wies darauf hin, dass gemeinschaftlich entwickelte Foundation-Modelle die Innovation im Bereich der biomolekularen KI beschleunigt hätten. Bayer nutze diese Modelle zur Analyse von Kristallstrukturen, zur Verbesserung der Wirkstoffentwicklung und von Merkmalen in der Pflanzenwissenschaft sowie zur Untersuchung von Proteininteraktionen und zur Simulation von Enzymkatalyse.

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